EGEE News №4 2006 (14)



.
EGEE News - июль 2006



EGEE заканчивается, EGEE-II набирает обороты

Пока EGEE-II находился на стадии разработки, многие участники проекта продолжали работать над завершением EGEE. Кульминацией этой работы стало заключительное ревю, прошедшее 22-23 мая 2006 года в ЦЕРНе, Швейцария. Ревю касалось не только окончательных результатов EGEE, но и планов по EGEE-II и дальнейшей работы.

Рецензенты дали положительные заключения по работе EGEE и приняли все разработки и этапы работ, проведенные за последний период проекта. На них произвел сильное впечатление масштаб работ по проекту в различных областях, они убедились, что действительно создан и успешно работает грид впечатляющих размеров и широкого использования.

Похвалы заслужило и программное обеспечение проекта, было отмечено успешное слияние gLite and LCG-2. Рецензенты убедились, что это объединение послужит прочным основанием для дальнейшего развития программного обеспечения EGEE на втором этапе проекта. Впечатляют также достижения в обучении и распространении информации о проекте за последние два года.

Рецензенты отметили выполненную проектом работу, потребовавшую больших усилий и направленную на то, чтобы EGEE стал инкубатором для многих родственных проектов, основанных на технологии EGEE – от приложений в области здравоохранения до распространения технологий в новых географических районах. Высокой похвалы удостоились не только достижения проекта в Европе, но и его работа в глобальной сфере – как в плане кооперации, так и во вкладе в создание общих стандартов через такие структуры, как Глобальный грид-форум (Global Grid Forum)
www.ggf.org.

Ревю сопровождал Кирьякос Бахчеванидис - член руководства проекта EGEE и заместитель начальника отдела исследовательских инфраструктур Еврокомиссии. В письме, приложенном к отчету о ревю, он выразил свое удовлетворение проектом.

"Я бы хотел поблагодарить всех членов консорциума EGEE за выдающиеся успехи, достигнутые проектом за эти два года, за действия по структурированию, которое проект вносит в область европейских исследований по гриду, и за ваше сотрудничество с моими коллегами и со мной за время существования EGEE. Мне бы хотелось пожелать вам успехов в использовании результатов EGEE и в EGEE-II".

Директор проекта Боб Джонс поддержал это мнение, заявив: "Было большим удовольствием работать со всеми участниками EGEE в течение последних двух лет. Большое число людей посвятили себя осуществлению амбициозных задач проекта, и хвала им всем за то, что мы выполнили наши задачи, а во многих случаях и значительно превзошли их. Теперь у нас есть самая большая в мире многоотраслевая грид-инфраструктура, выполняющая свыше 25 000 заданий в день. Продолжающаяся напряженная работа участников проекта должна сделать EGEE-II таким же успешным проектом, каким был EGEE".

Owen Appleton
CERN, Switzerland

Совместная работа EGEE и ITU

За последние два месяца Международный союз телекоммуникаций (ITU - International Telecommunications Union) при поддержке EGEE успешно провел серию широкомасштабных операций по обработке данных в рамках Региональной конференции ITU по радиокоммуникации (RRC-06 - Regional Radiocommunication Conference), проходившей с 15 мая по 16 июня 2006 года.

Обработка данных производилась в течение пяти недель через регулярные промежутки времени. Целью этой обработки было быстрое нанесение на карту результатов различных сценариев согласования между странами-участниками с целью установления новой схемы распределения частот для ввода цифрового радиовещания в Европе, Африке, арабских государствах и в странах бывшего СССР. Для этого было использовано современное программное обеспечение, разработанное Европейским союзом радиовещания (EBU - European Broadcasting Union). Параллельно с собственной вычислительной системой ITU, состоящей из 100 ПК, анализ выполнялся на гриде EGEE, включающем свыше 400 ПК. Это одновременное вычисление на гриде не только дало те же результаты и за меньшее время, что и на локальной системе, но и продемонстрировало, что распределенная инфраструктура обладает дополнительной емкостью и дополнительными средствами защиты. Среди сайтов EGEE, обеспечивших поддержку грида, были ЦЕРН, несколько сайтов INFN в Италии (CNAF, Болонья, Бари, Пиза), PIC (Барселона, Испания), CNB (Мадрид, Испания), DESY (Гамбург и Цойтен в Германии), Cyfronet (Краков, Польша) и Московский государственный университет (Россия).

Соглашение, подписанное в результате всех согласований, провозглашает развитие полностью цифровых наземных служб для радио и телевидения. Председатель конференции мистер Кавусс Арасте сказал, что конференция была технически сложным процессом, охватывающим задачи большого объема вычислений и обработки данных, работу с электронными документами и использование пяти рабочих языков. Более 1000 делегатов, представлявших 104 страны, собрались в Женеве, чтобы выработать соглашение, которое заменит соглашения по аналоговому радиовещанию, существующие с 1961 года для Европы и с 1989 года для Африки. Главной проблемой, с которой столкнулась конференция, был поиск путей для сосуществования цифрового и аналогового радиовещания в радиочастотном спектре во время трансформации частоты. Ключевым моментом, обеспечившим успех конференции, был беспрецедентный уровень сотрудничества между ITU, EBU и представителями EGEE в ЦЕРНе.

Выступая от имени EGEE и ЦЕРНа на одном из пленарных заседаний конференции ITU, руководитель отдела ИТ в ЦЕРНе Вольфганг фон Рюден рассказал, как гриды могут предоставлять надежные вычислительные услуги по требованию и для таких задач, для которых существует ограничение по времени, подобных задаче, стоящей перед ITU. Перенос анализирующей программы в грид оказался относительно легким благодаря тесному сотрудничеству между организациями, участвовавшими в этом процессе.

Massimo Lamanna & Francois Grey, CERN, Switzerland



Сайты EGEE, сотрудничающие с ITU
Сайты EGEE, сотрудничающие с ITU


Ускорение исследований рака в США

В настоящее время исследователи рака находятся в центре информационного взрыва, независимо от того, изучают они геномы животных или истории болезней людей. Новые методы биомедицинских исследований порождают огромный объем данных, что увеличивает шанс совершить прорыв в науке, но и затрудняет достижение результатов. Проект caBIG (cancer Biomedical Informatics Grid) разрабатывает вычислительную инфраструктуру, призванную помочь ученым ускорить получение результатов для предотвращения и лечения рака путем синтезирования, стандартизации и анализа всех этих данных.

Пилотный проект caBIG
https://cabig.nci.nih.gov, финансируемый Национальными институтами здравоохранения и координируемый Национальным онкологическим институтом, устанавливает связи между людьми и институтами и между технологиями и средствами их реализации.

"Мы взяли на себя решение главных организационных и социальных проблем, вызванных созданием большого сообщества географически разделенных людей и институтов для совместной работы" - говорит Петер Ковиц, главный операционный директор Центра биоинформатики Национального онкологического института. Трехлетняя программа пилотного проекта caBIG началась в феврале 2004 года, и за это время сообщество разрослось примерно до 500 исследователей из институтов США. Разработчики сосредоточились на нескольких направлениях, необходимых для исследовании рака, включая стандартизацию форматов данных и инструментальных средств, онтологий и семантики. Взаимодействие ученых с системой здравоохранения порождает ряд трудных задач для грид-инфраструктуры, связанных с безопасностью и конфиденциальностью.

"Сохранение конфиденциальности является не просто технологической задачей, но задачей социальной" - объясняет Ковиц. "Рак – это заболевание на генетическом уровне, и разделенное использование генетических данных может привести к нежелательной идентификации больного".

Пока часть членов сообщества caBIG была занята выработкой политики совместного использования медицинских данных институтами во всем мире, другая часть сосредоточилась на разработке и адаптации технологий безопасности для решения задачи разделенного использования медицинских данных в caGridе, грид-инфраструктуре caBIGа. Стенд caGridа работает с 2005 года, и сейчас в него входит 10 узлов, предлагающих различные данные или аналитические службы. Поскольку многие приложения, которые будут доступны через грид, используются уже сегодня, цель Ковица для caGridа – сделать для исследователей легким (и даже автоматическим) использование этих инструментальных средств, данных и служб. Ковиц и другие руководители caBIGа проектируют первую промышленную версию caGridа и готовятся к переходу от пилотного проекта к промышленному проекту в марте 2007 года.

"В итоге caBIG ускорит усовершенствование диагностики, лечения и предотвращения рака" - говорит Ковиц. "Преимущества caBIG для исследователей рака будут постепенно расти по мере добавления новых компонент программного обеспечения. Мы действительно хотим, чтобы ученые могли больше времени посвящать занятиям наукой и поиском ответов на самые насущные вопросы, имея под рукой современные вычислительные средства".

Katie Yurkewitz, Fermilab, USA
Reprinted courtesy of Science Grid This Week


Грид стремится к успеху в промышленности и KITE-клубе

Представители GridPP, EGEE и Национальной грид-службы Великобритании недавно встречались с деловыми кругами, чтобы обсудить, как Грид может обеспечить решение некоторых задач, стоящих перед промышленностью. Встреча состоялась в Инновационном центре Сент-Джон в Кембридже. EGEE был представлен директором проекта Бобом Джонсом, а о работе GridPP и планах по контактам с промышленностью рассказал руководитель проекта GridPP Тони Дойл.

Встреча была организована KITE-клубом (Knowledge Innovation Technology Enterprise) PPARCа (Particle Physics and Astronomy Research Council) и собрала экспертов из грид-проектов и представителей промышленности для открытой дискуссии о возможностях передачи технологий. Благодаря презентациям, представленным исследователями, PPARCом и представителями малого бизнеса, участники встречи могли лучше понять, какие преимущества могут получить приложения в сфере бизнеса, если использовать грид-технологию. Присутствующие услышали, как компаниям, производящим генные продукты и занимающимся обработкой цифровых изображений, грид мог бы помочь в их работе. Боб Джонс говорил о роли Форума промышленности EGEE (Industry Forum) и его взаимодействии с бизнесом.

PPARC предоставляет субсидии для совместной работы с промышленностью, и после этой встречи по крайней мере две компании уже получили поддержку для реализации их проектов. Александр Ефимов из KITE-клуба считает встречу большим успехом: "На первый план вышли вопросы о том, где грид-компьютинг может создавать новые решения промышленных задач и как организации могут извлекать выгоду из использования мощных вычислительных ресурсов грида. Встреча показала, что и небольшие предприятия могли бы использовать грид-компьютинг для достижения своих целей".

С этим согласился Тони Дойл: "Было очень поучительно узнать, что есть много компаний, которые извлекли пользу из работы, выполненной нами для физики элементарных частиц. GridPP очень стремится к партнерству с промышленностью, и мы будем сотрудничать со всеми фирмами, которые этого пожелают".

Как пояснил Боб Джонс, EGEE был также активен в этой области: "некоторые компании уже работают с EGEE, либо как пользователи, либо как поставщики сайтов, входящих в инфраструктуру. Передача технологий является нашей главной целью, поскольку проект финансируется Евросоюзом, и мы приложим все усилия для расширения связей с промышленностью на втором этапе EGEE".

Neasan O’Neil, GridPP, UK
Reprinted courtesy of GridPP


Собрание e-IRG в Вене

В начале июня рефлекс-группа сетевой инфраструктуры (e-IRG - e-Infrastructure Reflection Group) провела свою седьмую встречу в Вене, где делегатов e-IRG принимала Австрийская грид-инициатива совместно с министерством образования, науки и культуры. Директор проекта EGEE Боб Джонс присутствовал на встрече в качестве приглашенного наблюдателя и члена группы задач e-IRG по устойчивым е-инфраструктурам (Sustainable e-Infrastructures Task Force). Присутствовали также и другие члены EGEE - делегаты от разных стран, и были представлены институты, являющиеся нашими сотрудниками и партнерами.

Предметом обсуждений были взаимоотношения e-IRG и Европейского стратегического форума по исследовательским инфраструктурам (ESFRI - European Strategy Forum on Research Infrastructures), и e-IRG согласилась поддержать план действий ESFRI, в особенности в том, что касается е-инфраструктур. В преддверии принятия Седьмой рамочной программы e-IRG в конце апреля представила Еврокомиссии доклад, содержащий рекомендации по достижению устойчивости е-инфраструктур. Кирьякос Бахчеванидис (Еврокомиссия)- личность, известная членам EGEE, сообщил делегатам, что доклад был принят и одобрен Еврокомиссией. Делегаты решили, что они теперь тоже могут представить эту последнюю версию своим национальным органам, принимающим решения и выделяющим субсидии.

Другим успехом встречи было соглашение об изменениях в структуре e-IRG. Делегаты решили, что e-IRG уже готова к тому, чтобы председательствующий был более постоянным, а не сменялся, как сейчас, каждые шесть месяцев. В течение следующих шести месяцев пройдут выборы председательствующего, который будет оставаться на этом посту два года. Одним из главных результатов встречи являются Белые страницы e-IRG, представляющие обзор современного состояния дел во многих областях е-инфраструктур и дающие рекомендации по дальнейшему развитию. Члены EGEE приняли активное участие в работе над текущей версией Белых страниц как в качестве редакторов отдельных глав, так и в качестве спонсоров.

Joanne Lawson, CERN, Switzerland